細胞轉染在科學(xué)研究中扮演著(zhù)十分重要的角色，但也是最容易被忽略的一環(huán)。轉染效率的高低不僅影響實(shí)驗結果，甚至可能導致得到的實(shí)驗結果是無(wú)效的。在多種類(lèi)型核酸的細胞轉染實(shí)驗中，研究者們常需要進(jìn)一步優(yōu)化轉染條件以達到最優(yōu)的轉染效率，特別是較難轉染的細胞，而針對特定細胞類(lèi)型選擇對應專(zhuān)業(yè)化的轉染試劑只是邁向轉染實(shí)驗成功的第一步。

成立于1995年的Mirus Bio，專(zhuān)注及深耕核酸遞轉領(lǐng)域多年，從最早具有低毒性的TransIT ® -LT1到GMP級別、可用于AAV和LV生產(chǎn)的TransIT-VirusGEN® (產(chǎn)品年鑒請見(jiàn)圖1)。直至文稿發(fā)布時(shí)，使用Mirus產(chǎn)品發(fā)表文章已超過(guò)1萬(wàn)篇，并且發(fā)表文章及Mirus數據庫涵蓋了超過(guò)1200種細胞類(lèi)型。

圖1 Mirus產(chǎn)品年鑒

在細胞轉染實(shí)驗中，研究者們常常會(huì )忽略轉染效率/成功率的評估，那么是否有對應技術(shù)或者方法允許實(shí)時(shí)監測DNA/RNA的成功遞送以及細胞內的分布狀態(tài)呢？Mirus Bio Label IT® 核酸標記試劑盒為廣大的科研工作者提供了一個(gè)方向。Label IT® 核酸標記試劑盒可對任何類(lèi)型核酸，進(jìn)行高效、直接的標記，并且為on-step的實(shí)驗操作。基于非酶反應的標記方法，在不損傷核酸完整性、不影響基因表達的前提下，將選擇的標記 (熒光、生物素、地高辛等)以共價(jià)的方式連接到核酸上。

Label IT® 試劑盒有多種標簽可供選擇，包括 Cy®3、Cy®5、CX-羅丹明、TM-羅丹明、熒光素、MFP488、地高辛、生物素和二硝基苯基(DNP)。Label IT® 核酸修飾試劑盒（胺）也可用于基于胺的功能基團進(jìn)行DNA或RNA修飾。產(chǎn)品特點(diǎn)如下：

• 可用于標記任何DNA或RNA模板——適用于多種應用 (In vitro & in vivo)，如Crispr基因編輯、核酸遞轉、RNA干擾/表達實(shí)驗、FISH、Microarray等；
• 一步法標記——簡(jiǎn)單、輕松即可完成穩定的模版標記反應；
• 可根據實(shí)驗需求或應用，調節標記的密度——以獲得最佳檢測標記 DNA 或RNA 的靈敏度；
• 基于共價(jià)化學(xué)反應——對核酸殘基的修飾為永久性、無(wú)損傷的，是多種科研應用的理想選擇。

絕大多數基于分子和生物學(xué)的In vitro 及 in vivo研究都依賴(lài)于核酸的標記或標簽，理想情況下，此類(lèi)標記或標簽不會(huì )影響核酸功能以及研究結果。因此，也發(fā)展出來(lái)多種核酸標記方式，大致可以歸為以下兩類(lèi)：

-      化學(xué)標記法：基于結合核酸的反應基團，比如Mirus Label IT® 核酸標記試劑盒屬于此類(lèi)，并且整個(gè)反應過(guò)程并不需要酶的參與。

Label IT® 化學(xué)標記試劑由三個(gè)部分組成（如圖2）：

(1)      標簽/標記 (綠色區域)；

(2)      Linker，與核酸進(jìn)行靜電相互作用 (黃色區域)；

(3)      Label IT® 試劑以共價(jià)形式連接到核酸中活性雜原子的烷基化基團(藍色區域)。

圖2. Label IT®標記分子示意圖

-      基于酶反應標記法：通過(guò)酶促反應，在該反應過(guò)程中加入標記修飾的核酸。

當待研究的核酸加入標記后，可通過(guò)以下兩種方式進(jìn)行檢測：

-      直接檢測：這時(shí)，標記的核酸中包含了可用于光學(xué)、發(fā)光或產(chǎn)生熒光信號的報告分子。

-      間接檢測：標記的核酸帶有標簽或標記，該標記需要特異性的結合報告偶聯(lián)分子，如生物素結合帶有熒光標記的鏈霉親和素，地高辛結合帶有熒光標記的特異性抗體等。

• Label IT® 核酸標記試劑盒——不改變核酸結構功能

基因沉默相關(guān)功能研究在分子和細胞生物學(xué)中發(fā)揮著(zhù)重要作用，化學(xué)轉染也在該研究領(lǐng)域扮演者重要角色。小干擾 RNA (Small interfering RNAs, siRNA)，常作為研究各種類(lèi)型細胞中蛋白功能核酸類(lèi)型，通過(guò)有效的knockdown從而影響基因表達。那么，加入Label IT®標記的核酸，是否會(huì )改變核酸結構，從而影響到后續實(shí)驗結果呢？

評估測試使用Label IT® siRNA Tracker? 試劑盒，將相同siRNA加入不同標記 (CyTM3, CyTM5, 熒光素, CX-羅丹明 )以及沒(méi)有標記siRNA，轉染后，可通過(guò)熒光顯微鏡觀(guān)察到帶有標記的siRNA。基因表達結果顯示，帶有不同標記的siRNA，其目的基因表達水平近似，意味著(zhù)加入Label IT®標記的核酸，并不影響目的基因表達及功能 (圖3)。

圖3  Label IT® siRNA Tracker? 試劑盒評估測試

• Label IT® 核酸標記試劑盒——前沿應用舉例

應用一：使用Label IT®技術(shù)，富集CRISPR'd細胞

Nasri 和 Mir 等人在文章中闡述了如何通過(guò) Label IT® 技術(shù)，富集 CRISPR/Cas編輯成功的細胞。基因組編輯實(shí)驗面臨最大的挑戰之一是如何從未編輯的細胞中成功的篩選/富集出成功編輯的細胞，特別當未被編輯的細胞相對于成功編輯的細胞，具有生長(cháng)/增殖優(yōu)勢，使得細胞篩選變得更加困難。

為了高效的區分經(jīng)過(guò)基因編輯及未編輯的細胞，作者在CRISPR引導RNA ( gRNA) 與 Cas9 形成復合物及轉染細胞前，使用Label IT®對gRNA進(jìn)行了熒光標記，實(shí)驗流程示意圖如下：

研究結果表明，使用Label IT®標記的gRNA 不會(huì )影響基因編輯效率，并且可通過(guò)熒光分選/富集成功編輯的細胞群。進(jìn)一步地，研究者們將該 CRISPR 實(shí)驗流程應用于針對多種細胞類(lèi)型的GADD45B基因編輯實(shí)驗。根據細胞類(lèi)型的不同，經(jīng)過(guò)Label IT®標記的細胞亞群中，其成功編輯細胞占比相對于總細胞群體提了15-40%。

發(fā)表文章信息：

標題: Fluorescent labeling of CRISPR/Cas9 RNP for gene knockout in HSPCs and iPSCs reveals an essential role for GADD45b in stress response
作者: Masoud Nasri, Perihan Mir et al.
雜志: Blood Adv, Volume 3(1), Jan 2019.
DOI: 10.1182/bloodadvances.2017015511

應用二：使用Label IT®技術(shù)，聚焦于免疫系統研究

Label IT® 核酸標記技術(shù)可用于一種新型疫苗注射方法-微針陣列(microneedle array, MNA)的表征研究。傳統的疫苗注射方法是通過(guò) 3 厘米以上長(cháng)度的針頭進(jìn)行皮下注射，而微針陣列則是由微米級針頭所組成(示意圖如下)，以無(wú)痛的方式細微的的穿透皮膚，進(jìn)入到富含免疫細胞群，可減少患者的不適感。

為了提高疫苗的效力(efficacy)，通常會(huì )將免疫刺激分子或 "激動(dòng)劑(agonists) "與疫苗的靶標或抗原一同加入疫苗制劑中。Edwards 等人的研究表明，雙鏈 polyIC RNA 和單鏈 CpG DNA 寡核苷酸可作為微陣列中的激動(dòng)劑(agonists)。并且，研究者們認為帶負電荷的核酸激動(dòng)劑(agonists)和帶正電荷的抗原之間的靜電相互作用，幫助了微陣列的組裝。通過(guò)使用 Label IT® Cy®3 和 Cy®5 ，分別針對以上兩種核酸類(lèi)型進(jìn)行熒光標記，方便用于查看標記核酸在微針上的分布，這樣就允許了研究者們按照所需要的特定比例，將兩種激動(dòng)劑均一的加入到微陣中，從而使得精確的調整微針陣列 MNA 疫苗的免疫反應成為可能。

發(fā)表文章信息：

標題: Tuning innate immune function using microneedles containing multiple classes of toll-like receptor agonists
作者: Camilla Edwards, Robert Oakes et al.
雜志: Nanoscale, Volume 15, Apr 2023.
DOI: 10.1039/D3NR00333G

• Label IT® 核酸標記試劑盒-產(chǎn)品選擇

Label IT®試劑盒共有以下四種形式可供選擇，以應對研究人員核酸標記實(shí)驗的不同應用場(chǎng)景需求：

• Label IT® Nucleic Acid Labeling Kits
• Label IT®Tracker? Intracellular Nucleic Acid Localization Kits
• Label IT® siRNA Tracker? Intracellular Localization Kits
• Label IT® Nucleic Acid Modifying Kits

下表總結了不同種類(lèi)Label IT®試劑盒區別：

• 更多有關(guān)產(chǎn)品常疑問(wèn)FAQ，請查看官網(wǎng)鏈接

• Label IT® 核酸標記試劑盒-實(shí)驗優(yōu)化之核酸標記密度

理想的密度取決于被標記的核酸類(lèi)型及下游應用。在需要直接追蹤核酸的實(shí)驗中，更適合較高的核酸標記密度；而在想要維持/完整的還原標記核酸的生物學(xué)功能的實(shí)驗中，則更加適合較低的標記密度。使用 Label IT® 核酸標記技術(shù)，可以輕松調整到理想的標記密度。

Label IT® 試劑與核酸的比例(v:w)的改變與標記密度呈線(xiàn)性相關(guān)性(圖 4)。例如，按照說(shuō)明的初次實(shí)驗建議，需加入 5 μl Label IT® 試劑標記 5 μg DNA，此時(shí)v:w比例為1:1。在保證孵育時(shí)間和 DNA 量不變的條件下，如將 Label IT® 試劑的量降低為 2.5 μl 或 增加到10 μl，標記密度將分別降低一半或增加一倍。

實(shí)驗Tips：使用過(guò)高的 Label IT® 試劑量（超過(guò)建議量的 4 倍），可能會(huì )導致核酸裂解或引起 Label IT® 熒光基團淬滅。

核酸標記密度與所使用的 Label IT® 試劑量及反應的孵育時(shí)間呈正線(xiàn)性相關(guān)。可通過(guò)調整反應中 Label IT® 試劑的用量或反應的孵育時(shí)間 (孵育溫度仍為37℃)，可輕松靈活的調整到所需要的理想標記密度。

圖4. 核酸標記密度與Label IT®試劑用量和反應孵育時(shí)間成正比

實(shí)驗Tips：如何計算核酸標記密度，詳細實(shí)驗步驟及方法請見(jiàn)“Calculate Nucleic Acid Labeling Density”。

Mirus Bio公司介紹

Mirus成立于1995年，始終秉承著(zhù)為基因遞轉提供優(yōu)化方法及高效的工具。憑借超過(guò) 25 年轉染領(lǐng)域的深根細作，獲得了多項技術(shù)突破，已成為核酸遞送領(lǐng)域的全球領(lǐng)導者和值得信賴(lài)的品牌。Mirus科學(xué)家團隊不斷突破轉染技術(shù)的極限，推出了VirusGEN®轉染試劑與RevIT?增強劑，進(jìn)一步提升AAV/Lv產(chǎn)量，助力推動(dòng)生物治療藥物的降本增效，為CGT領(lǐng)域客戶(hù)賦能。

北京西美杰科技有限公司是Mirus中國區總代理，始終秉承著(zhù)專(zhuān)業(yè)、嚴謹的態(tài)度為客戶(hù)提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品與服務(wù)，Mirus熱銷(xiāo)轉染產(chǎn)品常備現貨。如果您對上述產(chǎn)品感興趣，歡迎致電北京西美杰客服熱線(xiàn)400-050-4006或登錄網(wǎng)站www.nnhuixin.com了解更多產(chǎn)品信息。